戏说药典控制菌的代表逻辑

沁人绿茶.

撰稿 | 石决明
来自 | 蒲公英Ouryao  
随着新版药典中收录洋葱伯克霍尔德菌群检查法，控制菌检查项目达到了8个。同时，相应的药典检测要求的分类水平和培养基适用性检查用的菌株信息也得到了更新。汇总信息如下表所示。



01“复合群”是什么分类水平？

分类学等级从高到低为：域>界>门>纲>目>科>属>种，每一级均反映了生物的进化关系和亲缘远近。除了耐胆盐革兰氏阴性菌属于人为的分类，现行药典中的其余控制菌项目都可以在分类水平上找到定位。

举例说明（以洋葱伯克霍尔德菌为例）

• 域：细菌域(Bacteria)
• 界：原核生物界(Prokaryota)
• 门：变形菌门(Proteobacteria)
• 纲：β-变形菌纲(Betaproteobacteria)
• 目：伯克霍尔德菌目(Burkholderiales)
• 科：伯克霍尔德菌科(Burkholderiaceae)
• 属：伯克霍尔德菌属(Burkholderia)
• 种：洋葱伯克霍尔德菌(Burkholderia cepacia)
  
  

而在“种”之下，还会有一些附加分类等级。亚种(Subspecies)：种内因地理或生态差异产生的细分（如Homo sapiens sapiens）。变种(Variety)：基于形态或生理特性的小类（如植物中的不同栽培品种）。模式种(Type Species)：属或科的代表性物种（如伯克霍尔德菌属的模式种是B.cepacia）。复合群(Complex)：基因型或表型多样但未完全分化的类群（如洋葱伯克霍尔德菌复合群Bcc）。但是，这还不是分类的终点。查看表格中的实验用菌株就可以发现，带有保藏机构菌种编号才是真正的菌株。当然还有保藏机构没有收录的菌株。所以，菌株命名通常附加在物种拉丁学名之后，可通过种加词、编号或符号体现其特性。

小结一下：洋葱伯克霍尔德菌群（Bcc）是种之下的一个附加分类小群，在分类学上不算什么大类。

02 现有控制菌代表逻辑推测
为了说明每个控制菌用选择性培养基的适用性，就必须使用相应的控制菌进行实验。如果水平范围太广，就要选择相应分类水平下最有代表的菌株。从已有的菌株选择结果，我们大概可以倒推出代表逻辑。

逻辑1：如果药典中分类水平是“种”的，直接选择这个种就行。

比如大肠埃希菌、铜绿假单胞菌和金黄色葡萄球菌。

逻辑2：如果药典中分类水平是“属”的，选择一个代表种。

比如乙型副伤寒沙门菌属于沙门菌属中常见的致病血清型（B群），能反映沙门菌的典型生化反应（如TSI斜面变红、底层变黄）和致病性，且覆盖药典要求的沙门菌A-F O多价血清初筛范围；又比如梭菌检查选择生孢梭菌，因其产孢特性可验证培养基对芽孢的促生长能力，同时排除非产孢菌的干扰。逻辑3：如果是耐胆盐革兰氏阴性菌，范围比“属”更大的，选择代表科或代表属中的代表种。比如大肠埃希菌和铜绿假单胞菌分别代表肠杆菌科和假单胞菌属的耐胆盐革兰阴性菌，其胆盐耐受性、代谢特性（如乳糖发酵）和生长条件（如42℃培养）均符合耐胆盐革兰阴性菌的典型特征。

小结一下：先范围缩小到种，然后种内选一个代表株。

03 为什么是这三株菌代表Bcc？
要说明中国药典为什么要选择这三株菌来代表Bcc，要先从美国药典说起。

美国药典中选择的三株代表菌与中国药典的稍有不同，具体见上表。首先，这三株菌正好是Bcc基因型分类的前三个。




其次，Bcc是肺囊性纤维化(CF)的病原体。在国外进行的多次流行性病统计中，B.cenocepacia是CF中最常见的物种（平均流行率=67%），B.multivorans为其次要Bcc物种（平均流行率=17%）。其余正式命名物种占Bcc复合体引起的CF感染不到10%。至于，中国药典为什么选择神秘伯克霍尔德菌（B.aenigmatica）而抛弃多食伯克霍尔德菌（B.multivorans）？前文：中美药典洋葱伯克霍尔德菌检查对比说过。
理由是：Bcc与高浓度干扰菌（如铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌）共存时，某些生长缓慢的Bcc菌株（如神秘伯克霍尔德菌）可能被漏检。

仿照上文逻辑，神秘伯克霍尔德菌（B.aenigmatica）在分类学上排名靠后，同时暂时还没有流行性病学数据。

xqliu

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浅瞳1

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psh0302

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