不做基因合成的工程师不是一个好IT

仲夏秋夜云

不做基因合成的工程师不是一个好IT

小妖去了一趟泓迅科技公司，与以往一样，我都是冲着妖孽的技术去。这一次的技术，怎么说呢……你以为它是一家生物科技公司，其实它是一个“IT公司”；你以为合成DNA只是生物制药企业的服务商，其实它撬动的可能是世界惯性。

1.它是一个基因合成技术

首先，他是合成了DNA，而且目前以此为业。所以它帮助一些生物制药企业合成目标DNA，包括引物和基因。同时也设计并合成DNA文库用于筛选目标基因，发现目标抗体，合作方包括中科院微生物所的寨卡病毒研究项目。

2.它合成的DNA是一段序列

这是句废话，但必须强调一下。它可以合成任一排序的DNA。而在合成前，它有自己的计算机系统可以设计或优化这段序列。同时，一段DNA序列可以在它的软件系统中得到结构解读。

3.ATCG和010110，你觉得差在哪里？

这看起来是毫不相关的东西，在这家公司的技术就很有趣。

我们总是给很多东西进行编码，比如说蒲公英，拼音编码：pugongying，五笔编码：aigywcamd。那么，谁又说我们目前用的电脑、网络……数据存储就应该基于二进制的010110这样的东西呢？有人问，所谓创新是什么？说起来就是打破规则，那么现在我们是否勇于打破数据存储的规则呢？

蒲公英的“基因”

好了，以上大概是这家公司让我三伏天能跑一趟的原因：它是一个基因科技公司，也为医药行业服务，但还在进行着IT数据存储研究。

我们的基因编码有多大的容量？人类基因组约有30亿个碱基对，以DNA的形式储存在微米级的细胞核中，DNA具有不可思议的存储密度。那么看看这家企业做的事情。比如说，把一整部《论语》中的文字编码成了一段DNA序列，并且合成出来。要读取文件的时候，样品进机器，读谱。再利用软件还原出《论语》的文字。

看过那么多侦探题材的电影，你是否觉得侦探手段的黑科技太多了？比如说，反复擦拭清洗过的地板，喷上鲁米诺液体，在紫外灯下显示出荧光蓝，侦探们用棉签擦拭，依然可以测出血迹的主人DNA，查出此人有色盲。一滴血能查到几乎所有的遗传信息，而这些信息是天然遗传的。那么……如果这些信息可以人为制造呢？它不怕物理损坏，不怕进水，不怕高温，可复制，微小且稳定。

谁说我们需要移动硬盘？谁说一个网站需要购买服务器备份？那么多企业信息库备案……就连微软都突然意识到，也许我们有更简单的方式，而且不会遗失，反复可复制的方式……比如说那块被反复擦拭过的地板，用棉签取到的一滴水，也许就足够记录所有的数据备份。

这听起来是不是天方夜谭？可它已经很近了。

1ml的离心管，它可以是上千万部《论语》，哪怕把液体倒了，疑似残留物也足够读到所有的信息数据，在解读软件上，它可以变成一本书。说起来很简单，就是信息，编码，合成DNA，需要解读的时候，把DNA放到检测仪器中读谱，自动转码成文字或者图片。

好的，一个黑科技，来看看我提出的问题。

1.该技术，该公司是否在周期中闭环？

这项技术显然涉及几个步骤：信息，转码为DNA序列，合成这个序列，将这个序列放入载体，需要的时候将样品序列测序、解码。其中涉及的环节，该公司是否都能做到，是否有相关专利？关于这些，泓迅科技给了我一个专利列表，有兴趣的蒲友可以查阅学习一下。从DNA设计到合成，直至提取信息时需要的测序解读，他们都是自己的。所以……他应该是全国唯一。如果有其他企业有相同项目，请联络我，我非常感兴趣。

2.合成成本

使用过序列合成外包服务的都知道，这是按碱基对付钱的，当然越复杂越贵。显然，这项技术一定很贵。关于成本的问题，他们的解释倒非常有趣：就是通量大才做服务啊，通量大就便宜啊。他们有一个Synotype合成技术平台，目前到了第三代，也就是Syno®3.0芯片DNA合成。准确合成任意基因，同时对多重位点进行编辑，一张芯片一次合成万条引物，突变率＜5‰，价格最低可达到$0.09/bp。而且这个成本随着技术的提升，产能扩展，市场扩大，还会进一步降低。

3.我能理解信息读取，那么谁会选择用DNA储存信息呢？

这里有个显而易见的风险，假设DNA储存信息可行，那么读取端是很容易的，只要有一个手持式测序解码器即可。可是把信息贮存到DNA芯片里就很麻烦了，它可不想我们现在往U盘里写信息那么简单。这也许就是这个技术目前普及到个人和普通用户端最大的障碍，但对于大型企业和特种行业来说，这未尝不是一种机会。

手持式测序仪

4.关于编码规则

小妖喜欢开创游戏规则的人。任何一个编码模式都是一种游戏规则，蒲公英的拼音为啥就是pugongying呢？有人制定了规则，所有人执行了。那么我们把蒲公英的DNA碱基对定义成AUG，这规则是否能成为全世界的游戏规则呢？

微软也在开发DNA存储技术，如果按微软的说法，他们已经向Twist购买了2000万条DNA用于DNA信息存储研究。而Twist Bioscience今年与泓讯科技签署了合作协议。那么微软和泓讯科技，这套DNA编码规则会不会是一样呢？如果不一样，当未来的某一天，微软的公开预测是2020年，随着DNA存储服务的推出，会不会因为编码规则不一样，泓讯科技的这个DNA编码规则就贬得一文不值了呢？关于这个问题，泓讯科技给出的回答是：目前没有统一的编码规则，包括微软在内，全球有多家企业和研究机构也在致力于DNA存储研究，大家的编码规则还是各不相同，但合成、测序的技术平台是一样的。，从长远来看，编码解码规则的统一是有助于推动这项研究的发展，泓迅科技相关研究的开展不会因为编码规则的变更受到影响。

5.关于目前的运作、规模、合作

200人的团队，驻地在北京、上海、苏州、广州、新泽西……苏州为中心。2016年B轮融资，具体数额未公开公布，但小妖的个人评价是，这笔融资估值过低。

有人问，这类新科技到什么时候才能变成现实呢？小妖只对新东西感兴趣，仔细想想，我们的新药投入有几个是十年内看到盈利的？

2017年7月13日，哈佛大学的Shipman和Church等科学家把一部电影编码写进了细菌的DNA中，当解读这段DNA的时候，你可以看到一位骑士和战马的影像。Nature发表后，我们认为人类跨入了DNA信息存储时代。

Church教授说：目前，一个电极监测一个神经细胞，但大脑放不下860亿个电极，所以我们的想法是使细菌作为记录设备随血液到达大脑，记录一段时间的信息。然后科学家可以提取细菌液，通过它们的DNA了解大脑神经细胞的情况。

现在，你还觉得这个技术太遥远吗？也许只是我们的想象力不够，没有突破规则的能力。

无敌的寂寞

小菜鸡没看懂